Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRLP54845 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRLP54845 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRLP54845 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRLP54845 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRLP54845 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRLP54845 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NRLP54845 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRLP54845 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRLP54845 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRLP54845 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRLP54845 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRLP54845 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 655 ms