Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 AGE1YDR524C 1449 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 ARF1YDL192W 546 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 VAB2YEL005C 849 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 LOC1YFR001W 615 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YGR160WYGR160W 612 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YHR213WYHR213W 597 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YJL147CYJL147C 1149 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YAR062WYAR062W 597 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 ATP11YNL315C 957 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YCL002CYCL002C 792 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YCL007CYCL007C 393 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 HRD1YOL013C 1656 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YGR237CYGR237C 2358 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SRC1YML034W 2505 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 INO80YGL150C 4470 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SLU7YDR088C 1149 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YEL057CYEL057C 702 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YFL015CYFL015C 495 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YGR039WYGR039W 312 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 TPK3YKL166C 1197 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 UNG1YML021C 1080 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 CSI1YMR025W 888 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 BUD21YOR078W 645 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 IOC3YFR013W 2364 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SRO77YBL106C 3033 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 LCB4YOR171C 1875 nt3.18□□□□□ -1.9
HEF3P53978 RPO41YFL036W 4056 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 XRN1YGL173C 4587 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 snR70snR70 164 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 LST7YGR057C 729 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YIL054WYIL054W 318 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SDP1YIL113W 630 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YKL066WYKL066W 444 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YLR271WYLR271W 825 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 RPL6BYLR448W 531 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 INO4YOL108C 456 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YPR153WYPR153W 423 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 VBA4YDR119W 2307 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 GIS4YML006C 2325 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 DBP7YKR024C 2229 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SYO1YDL063C 1863 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 RCY1YJL204C 2523 nt3.17□□□□□ -1.9
HEF3P53978 MDM36YPR083W 1740 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 SMT3YDR510W 306 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 YKL091CYKL091C 933 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 NEW1YPL226W 3591 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 TAF2YCR042C 4224 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 NDC80YIL144W 2076 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 KRE2YDR483W 1329 nt3.16□□□□□ -1.9
HEF3P53978 RRM3YHR031C 2172 nt3.15□□□□□ -1.9
HEF3P53978 NSE4YDL105W 1209 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 RAV2YDR202C 1056 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 SMX2YFL017W-A 234 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 REC102YLR329W 795 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 PRM6YML047C 1059 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YOR050CYOR050C 348 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 TUM1YOR251C 915 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 RRP15YPR143W 753 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 APD1YBR151W 951 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 Q0017Q0017 162 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 PDR3YBL005W 2931 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 MAK21YDR060W 3078 nt3.15□□□□□ -1.91
HEF3P53978 SMC6YLR383W 3345 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 REG1YDR028C 3045 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YKL069WYKL069W 543 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 EMC6YLL014W 327 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 GIM5YML094W 492 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YOR055WYOR055W 435 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 RRD2YPL152W 1077 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 snR35snR35 204 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 BPT1YLL015W 4680 nt3.14□□□□□ -1.91
HEF3P53978 SEC15YGL233W 2733 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 PEX6YNL329C 3093 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 FMN1YDR236C 657 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 VMA5YKL080W 1179 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 SDS22YKL193C 1017 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 ATG38YLR211C 681 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 HHF2YNL030W 312 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 GCY1YOR120W 939 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YOR387CYOR387C 621 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YLR001CYLR001C 2589 nt3.13□□□□□ -1.91
HEF3P53978 BNA4YBL098W 1383 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 DYN1YKR054C 12279 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 VAC14YLR386W 2643 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 DYN2YDR424C 279 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 DIG2YDR480W 972 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 SLD5YDR489W 885 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 RSM18YER050C 417 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 AIM11YER093C-A 414 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 VMA10YHR039C-A 345 nt3.12□□□□□ -1.91
HEF3P53978 YOL114CYOL114C 609 nt3.12□□□□□ -1.91
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