Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACLYP53396 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACLYP53396 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACLYP53396 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACLYP53396 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACLYP53396 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACLYP53396 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACLYP53396 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACLYP53396 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ACLYP53396 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACLYP53396 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACLYP53396 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms