Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCNKBP51801 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLCNKBP51801 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms