Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB27AP51159 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB27AP51159 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms