Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB5CP51148 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RAB5CP51148 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RAB5CP51148 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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RAB5CP51148 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RAB5CP51148 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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