Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RGS4P49798 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RGS4P49798 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RGS4P49798 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGS4P49798 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGS4P49798 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RGS4P49798 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms