Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CYB561P49447 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CYB561P49447 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CYB561P49447 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CYB561P49447 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CYB561P49447 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CYB561P49447 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CYB561P49447 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms