Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEDD4P46934 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEDD4P46934 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms