Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ATRXP46100 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ATRXP46100 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATRXP46100 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATRXP46100 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATRXP46100 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATRXP46100 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms