Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THPOP40225 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THPOP40225 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THPOP40225 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THPOP40225 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THPOP40225 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THPOP40225 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THPOP40225 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
THPOP40225 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THPOP40225 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms