Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZEB1P37275 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZEB1P37275 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms