Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBRP36941 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBRP36941 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBRP36941 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LTBRP36941 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LTBRP36941 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms