Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT2P35908 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT2P35908 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT2P35908 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT2P35908 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT2P35908 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRT2P35908 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms