Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN2P35609 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN2P35609 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms