Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CTNNB1P35222 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNNB1P35222 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms