Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASQ1P31415 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CASQ1P31415 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
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