Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HOXC13P31276 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC13P31276 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms