Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HOXC12P31275 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms