Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA7P31268 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA7P31268 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms