Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CMPK1P30085 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CMPK1P30085 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms