Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTKP29376 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTKP29376 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
LTKP29376 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LTKP29376 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
LTKP29376 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LTKP29376 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LTKP29376 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LTKP29376 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LTKP29376 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LTKP29376 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LTKP29376 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LTKP29376 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LTKP29376 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
LTKP29376 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LTKP29376 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms