Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GTF2E2P29084 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GTF2E2P29084 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms