Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBL1P28749 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBL1P28749 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBL1P28749 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RBL1P28749 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBL1P28749 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBL1P28749 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms