Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PEX2P28328 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PEX2P28328 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PEX2P28328 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms