Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB4P28070 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB4P28070 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms