Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MCM3P25205 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCM3P25205 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MCM3P25205 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCM3P25205 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCM3P25205 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCM3P25205 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms