Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTAFRP25105 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTAFRP25105 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms