Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GABRR1P24046 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GABRR1P24046 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms