Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAMP1P23763 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
VAMP1P23763 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms