Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK11BP21127 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK11BP21127 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms