Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATF3P18847 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATF3P18847 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ATF3P18847 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATF3P18847 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATF3P18847 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATF3P18847 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATF3P18847 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF3P18847 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF3P18847 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATF3P18847 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATF3P18847 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ATF3P18847 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ATF3P18847 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms