Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL17P18621 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL17P18621 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL17P18621 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL17P18621 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL17P18621 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms