Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FLT1P17948 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FLT1P17948 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FLT1P17948 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms