Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPA1P15085 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CPA1P15085 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CPA1P15085 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CPA1P15085 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CPA1P15085 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CPA1P15085 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CPA1P15085 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CPA1P15085 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA1P15085 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA1P15085 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA1P15085 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CPA1P15085 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms