Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB3P14651 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB3P14651 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms