Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HOXD8P13378 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXD8P13378 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms