Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TOP2AP11388 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
TOP2AP11388 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
TOP2AP11388 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms