Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41P11171 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EPB41P11171 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPB41P11171 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPB41P11171 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPB41P11171 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPB41P11171 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPB41P11171 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms