Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HSPD1P10809 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSPD1P10809 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPD1P10809 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPD1P10809 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPD1P10809 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPD1P10809 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HSPD1P10809 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms