Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMEM225BP0DP42 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMEM225BP0DP42 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms