Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM17P0DL12 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMIM17P0DL12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms