Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
C4AP0C0L4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C4AP0C0L4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms