Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC3A2P08195 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC3A2P08195 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms