Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IGHG4P01861 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHG4P01861 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms