Protein–RNA interactions for Protein: P01733

TRBV12-3, T-cell receptor beta chain V region YT35, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV12-3P01733 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRBV12-3P01733 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV12-3P01733 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms