Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZBED1O96006 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZBED1O96006 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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