Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLR1AO95602 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR1AO95602 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms