Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GABARAPO95166 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GABARAPO95166 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms