Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLSTN1O94985 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLSTN1O94985 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms